中国发展网

产业发展

当前位置:首页 > 产业发展 > 产经要闻

中科曙光:精准医疗发展对先进计算平台提出更高要求

2019-07-10 19:52     中国发展网

中国经济导报 中国发展网 记者崔立勇报道 健康是所有人的追求,随着技术进步基于“个人”基因、病史等大数据分析的“精准医疗”,正成为各国医学界探索的新方向。

5d25826dbfc3d

近日,中科曙光在其官微发布了《先进计算“精准医疗”领域三大趋势》,该报告指出的三大趋势包括:第一,精准医疗对于HPC(高性能计算机)的需求将随着海量增加的基因数据和复杂的组学分析流程而全面升级;第二,云计算将成为“精准医疗”首选场景;第三,不同研究机构将联合建立可控的共享基因数据库。

据悉,自2015年美国前总统奥巴马提出“精准医疗计划”以来,包括我国的十余国家已提出相关计划。2016年,中国科技部首次召开“国家精准医疗战略专家会议”,计划在2030年前投入600亿元推动“精准医疗”发展。其中,“精准医疗”已离不开先进计算的支持。

《先进计算“精准医疗”领域三大趋势》指出,随着“精准医疗”的基因检测、组学分析等技术的发展,对“先进计算”平台提出了更高的性能与兼容性要求。

如针对“精准医疗”第三代基因测序、组学分析等技术的大批量、小规模,一次提交成百上千应用数据处理需求特点,以及多种基因检测及特征分析软件并存、更新迭代快且无统一标准的局面,HPC将全面升级,具备PB(十亿亿字节)级存储架构下,解决数据复杂流程分析能力,并适应软件的多样与多变。

目前,“个人”基因测序成本已下降到几百美金,但个人的“基因谱”如何才能得到系统的“精准医疗”检测,业界还没有完善产业模式。同时,谷歌、微软已开始通过云计算提供“基因云”等服务,因此未来更多“精准医疗”场景将首先通过“云计算”来实现。

此外,随着基因测序的普及,“精准医疗”产业链上的不同研究机构,将在可控条件下,交换共享基因数据,以提升各自在相关领域的研发能力和效率,建立可控的共享基因数据库。

对此“趋势”,中科曙光解决方案中心技术总监杨莉表示,曙光很早便为医疗机构提供“先进计算”解决方案。非典时期,曙光4000超级计算机无偿协助完成了SARS全基因组测序。

“‘精准医疗’发展依靠对海量医疗数据信息的存储、分析、利用,如何快速进行复杂流程的数据分析、将海量数据转化为可用信息,是精准医疗的难题,也是对先进计算平台的挑战。”杨莉表示,目前曙光已为“北京大学医学部”、“四川省人民医院”等超12所三甲级医院,以及“重庆市巴南医院”、“江苏泰州市人民医院”等超50家普通医院、县级医院、医疗机构等提供计算服务。

此外,曙光还与华大基因等“基因组学研发机构”合作,推动基因测序行业发展。而本次发布的“趋势”正是基于曙光为大量客户提供解决方案实践所得到的。

北京迈基诺基因科技股份有限公司首席IT架构与运维工程师王晓斌表示。目前“基因测序”数据作为“精准医疗”行业的基础,是整个行业投入资源最多领域。第二、三代“基因测序”软件,对计算平台的IO读写稳定与带宽,还有CPU性能要求较高。

王晓斌和同事在考察了多家供应商后,基于数据读写效率以及计算稳定性考虑,于2018年上半年采购了曙光可支持Infiniband网络的并行存储设备,以及四路服务器产品。

“从硬件到软件,曙光对Infiniband架构并行储存器都有完善的解决方案,对‘基因测序’软件的兼容性很好,整个存储系统运行一年多很稳定。”王晓斌说,今年他们还会继续加大在存储与计算设备领域的投入,以满足业务增长需求。

目前,中科曙光具备提供“精准医疗”全方位“先进计算”平台的成熟经验,对基因组、蛋白组、转录组和代谢组等组学技术的分析、存储、共享,以及精准医疗相关研究中大数据的分析、解读,具有从硬件、软件、维护的全面支持服务。

【责编:刘维】
北汽福田汽车股份有限公司(简称福田汽车),是一家跨地区、跨行业、跨所有制的国有控股上市公司。总部位于北京市昌平区,现有总资产近861多亿元,品牌价值达1328.67亿元,员工近4万人,是一个以北京为管理中心,在京、津、鲁、冀、湘、鄂、辽、粤、新等9个省市区拥有整车和零部件事业部,研发分支机构分布在中国大陆、日本、德国、中国台湾等国家和地区的大型企业集团。
深化5G技术创新与产业应用,提高5G+产业发展质量,根据市场的需求,开展的5G培训工作。
5G时代的全面来临将与云计算、大数据、人工智能、区块链等新技术融合应用,颠覆传统产业,催生新业态和新商业模式。
推进5G应用创新,加快5G全生态链的打造以及5G成果共享,已经成为产业新生态及智慧新生活创造无限可能。
5G科普培训项目,以政策为导向,以技木为引领,以产业为主体,以应用为核心,共同推进5G人才建设。
福田汽车是中国汽车行业自主品牌和自主创新的中坚力量,目前拥有卡车,轻客,皮卡,客车及环境装备,工程机械,智蓝新能源,专用车..
5G作为新基建的排头兵,如何利用5G新基建让企业逆势崛起、化危为机?这门课程亦将用垂直行业的创新案例,从技术、商业、趋势等多角度给出5G新基建的方法论,帮助企业提升经营效率,加速数字化转型,赢得生存与发展的新路径。
《城乡拼购》是衡水市扶贫办授权唯一消费扶贫电商平台。是以电商+直播带货相结合进行的产品销售和品牌推广。
美通社服务着全球七万多家企业和机构,每天以四十多种语言,帮助客户把他们的最新文字,图片和视频资讯发布给世界各地的目标受众,帮助他们和媒体,业界,投资者,有影响力人群以及普通公众沟通,为他们提高知名度,打造品牌、推动销售,吸引投资。
福田汽车是中国汽车行业自主品牌和自主创新的中坚力量,目前拥有卡车,轻客,皮卡,客车及环境装备,工程机械,智蓝新能源,专用车..